研讨之后发现迄今人类微生物组中最有用的溶菌酶

  广东工业大学生物医药学院教授林章凛团队与华南理工大学生物科学与工程学院副教授杨晓锋团队协作，成功构建了一种新式的人工智能结构DeepMineLys，并发现了迄今在人类微生物组中最有用的溶菌酶。近来，该研讨成果发表于《细胞陈述》。

  作为概念验证，该研讨从人类微生物宏基因组数据中辨认和发掘有医治耐药菌潜力的溶菌酶，标志着AI在生物学范畴使用的一个重要打破。

  “DeepMineLys不仅仅能够发掘溶菌酶，还具有发掘蛋白质的广泛使用潜力，为未来的生物学研讨供给了有力东西。”论文一起通讯作者林章凛表明，DeepMineLys的成功得益于构建了包括广泛噬菌体溶菌酶的全面练习数据集、集成了TAPE等先进算法和编码技能、采用了三层卷积神经网络和双轨架构等几个重要的条件，极大提升了模型的猜测功能。

  在独立数据集的验证中，DeepMineLys的F1分数到达84.00%，比较现有办法提升了20.84%。研讨人员从3个不同的人类微生物宏基因组数据会集成功辨认出1000多种新的溶菌酶，且类似度小于60%。他们早年100个候选溶菌酶中随机挑选了16个进行试验验证，其间11个被证明具有活性，最强的一个溶菌酶的活性乃至比传统溶菌酶高出6.2倍，成为迄今为止在人类微生物组中发现的最有用的溶菌酶。