记者9月2日得悉,广东工业大学生物医药学院教授林章凛团队与华南理工大学生物学院副教授杨晓锋团队协作,成功构建出一种新式的人工智能结构——DeepMineLys,并借此结构发现了迄今为止在人类微生物组中最有用的溶菌酶。近来,该研讨成果发表于《细胞陈述》。
“该研讨使用人工智能,从人类微生物宏基因组数据中辨认和发掘出有医治耐药菌潜力的溶菌酶,这是人工智能用于生物学研讨范畴的一个重要打破。”论文榜首作者、华南理工大学生物科学与工程学院2018级博士生付一然说。
林章凛以为,DeepMineLys的成功得益于构建了包括广泛溶菌酶的全面练习数据集,集成了TAPE等先进算法和编码技能,采用了三层卷积神经网络和双轨架构等几个重要的条件,极大地提升了猜测功能。
研讨团队早年100个候选溶菌酶随机挑选了16个进行试验验证,其间11个被证明具有活性,最强的一个溶菌酶的活性乃至比传统溶菌酶高出6.2倍,成为迄今为止在人类微生物组中发现的最有用的溶菌酶。“DeepMineLys不仅仅能够发掘溶菌酶,还具有发掘蛋白质的潜力。由此可见,该结构的构建为未来生物学研讨供给了一个有力的东西。”林章凛说。
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